הסנגוריה הצבאית, שבראשה הסנגור הצבאי הראשי, מעניקה שירות משפטי לחיילים ולקצינים שבעניינם נפתחה חקירה פלילית או נתקבלה החלטה על העמדה לדין, כפי שיפורט להלן:

• ייצוג נאשמים בפני בתי הדין המחוזיים, בית הדין הצבאי המיוחד, בית הדין הצבאי לערעורים ובית המשפט העליון, הן במהלך משפטם והן במסגרת דיוני מעצר. שיעור הייצוג על ידי סנגורים צבאיים בבתי הדין הצבאיים המחוזיים עומד על למעלה מתשעים אחוזים. כמו כן, מופיעה הסנגוריה בדיונים בבית משפט עליון ביושבו כבג"ץ, בעניינם של חיילים המיוצגים על ידי הסנגוריה הצבאית, בין היתר כעותר ציבורי.
• הגשת בקשות לביטול כתבי אישום לפצ"ר ולסגנו, וייצוג בהליכי שימוע טרם הגשת כתב אישום.
• ייעוץ לחיילים ולקצינים לקראת ו/או במהלך חקירת מצ"ח, ועדת חקירה ותחקיר צבאי.
• ייעוץ לחיילים ולקצינים העומדים לדין בפני בתי הדין הצבאיים לתעבורה, בהם אין ייצוג לנאשם כדבר שבשגרה, על פי חוק השיפוט הצבאי, וכן ייצוגם בפני בית הדין הצבאי לערעורים בהליכי ערעור.
• ייצוג חיילים, המרצים עונש מאסר במתקן כליאה צבאי או בשירות בתי הסוהר, בפני הוועדה לעיון בעונש, ובפני הוועדה העוסקת בהעברת כלואים לכלא אזרחי ("ועדה 210").
• ייעוץ וייצוג לחיילים בוועדות פרט ובהליכים אחרים הנובעים מן ההליך המשפטי (הדחה, השעיה, התרת התחייבויות, ועדות סמים וכד').
• סיוע לחיילים העומדים בפני הליכים משמעתיים במקרים המתאימים (קרי, מקרים שבהם להליך יש השלכה על המשך שירותם בשירות קבע, כדוגמת דין משמעתי בגין עבירות של הטרדה מינית).
• ייזום ושותפות בעבודת מטה בנושאים הקשורים לזכויות החייל, הן בהליכי החקיקה השונים והן בעתירות עקרוניות לבג"צ.

נוסף לכך, הסנגוריה הצבאית פועלת למען קיום הסברה רחבה בקרב חיילי צה"ל אודות מאפיינים הליכי השיפוט בצבא וזכויות החיילים אגב אותם הליכים.

כתבו עלינו - באתר דובר צה"ל

הוראת הפיקוד העליון מס' 2.0613 המסדירה את מעמד הסנגוריה הצבאית קובעת כי "סנגור צבאי לא יהיה נתון, בעת מילוי תפקידו, למרות מפקדיו, ותעמוד לנגד עיניו טובת הנאשם, בלבד".

בדומה לכל עורך דין – טובת הלקוח עומד בראש מעייניו של הסנגור הצבאי. משמעות הדבר היא שסנגור צבאי פועל תוך עצמאות מקצועית מוחלטת, ואינו נתון למרות מפקדיו בצבא בדרך ניהול ההגנה על לקוחותיו. ככל עורך-דין במדינת ישראל, חוקי המדינה והכללים האתיים של לשכת עורכי-הדין הם מגבלותיו היחידות, וטובת הלקוח היא האינטרס היחיד שעל שמירתו הוא מופקד.