ככלל, באיזור יהודה והשומרון לא חל הדין הישראלי. דיני המקרקעין באיו"ש מבוססים על חוק הקרקעות העות'מני, וכן על השינויים שנעשו בדיני המקרקעין בתקופה המנדטורית ובתקופת השלטון הירדני. גם בתחיקת הביטחון נעשו שינויים ותיקונים נוספים בדיני המקרקעין ככל שעלה צורך בכך.
רוב המקרקעין באיו"ש לא נרשמו באופן מסודר במרשם מקרקעין מאוחד (טאבו). לצורך רישום הקרקעות, ניתן לנקוט בהליך שנקרא "רישום ראשון של מקרקעין". במסגרת הליך זה נדונה בקשתו של מבקש הרישום בפני ועדה מיוחדת, אשר בודקת את המסמכים המוכיחים את הזכות של בעל המקרקעין, את מפת החלקה, את טענות המתנגדים לבקשה ואת המצב בשטח, ומחליטה אם להוציא צו לרישומם.
על החלטת הוועדה ניתן להגיש ערר לוועדת העררים הצבאית. הגורם שאליו ניתן לפנות לצורך הגשת בקשה לרישום ראשון הינו קצין המטה (קמ"ט) לרישום המקרקעין במינהל האזרחי.